棕背
Myodes rufocanus、大林姬鼠
Apodemus peninsulae和黑线姬鼠
Apodemus agrarius是东北地区主要的3种害鼠。动物肠道微生物伴随宿主进化与其胃肠道构成了复杂的微生态系统,并在肠道内发挥着重要作用。为研究3种啮齿动物肠道病毒组成及亲缘关系和生境2种因素对其的影响,本研究对在同一生境下的17只大林姬鼠、17只棕背
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以及另一生境中的9只黑线姬鼠肠道内容物样本进行宏基因组测序,对3种啮齿动物的肠道病毒组成及差异进行对比与分析。结果显示:Artverviricota、Uroviricota是3种啮齿动物共有的优势病毒门,
Betaretrovirus、Gammaretrovirus是3种啮齿动物共有的优势病毒属。此外,3种啮齿动物肠道病毒群落之间存在显著差异,有9个门18个属的病毒在不同样本中得到富集。在肠道相对丰度前10的病毒中,大林姬鼠与黑线姬鼠之间有5个门5个属具有显著差异,棕背
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与大林姬鼠之间有3个门和6个属具有显著差异。在门水平上棕背
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与大林姬鼠肠道病毒组成相似度更高,而属水平上则是黑线姬鼠与大林姬鼠肠道病毒组成更高。在门水平上生境对肠道病毒组成的影响较大,在属水平上则是亲缘关系对肠道病毒组成的影响较大。