广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2010, Vol. 28 ›› Issue (2): 91-95.

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桂林市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析

蒋就喜1, 李赫伟1, 周方2, 骆安德2, 徐茹1, 曾思恩3   

  1. 1.桂林医学院临床医学院传染病学教研室,广西桂林 541001;
    2.来宾市人民医院泌尿内科,广西来宾 546100;
    3.桂林医学院基础医学院病理学教研室,广西桂林 541001
  • 收稿日期:2010-04-25 出版日期:2010-06-20 发布日期:2023-02-07
  • 通讯作者: 周 方(1958—),男,湖南长沙人,广西来宾市人民医院院长,副主任医师。E-mail:gx-lbsrmyy@163.com
  • 基金资助:
    国家自然科学基金资助项目(30460141);广西科学基金资助项目(桂科自0640192);广西教育厅科研项目(桂教科研[2005]47)

Determination of Gene Sequence and Subtype Analysis of HIV-1 Strains in Guilin,China

JIANG Jiu-xi1, LI He-wei1, ZHOU Fang2, LUO An-de2, XURu1, ZENG Si-en3   

  1. 1. Department of Infectious Diseases,College of Clinical Medicine,Guilin Medical University,Guilin Guangxi 541001, China;
    2. Department of Urology,People′s Hospital of Laibin,Laibin Guangxi546100,China;
    3. Department of Pathological Histology,College of Basic Medical,Guilin Medical University, Guilin Guangxi 541001,China
  • Received:2010-04-25 Online:2010-06-20 Published:2023-02-07

摘要： 为了解桂林市HIV-1感染者中HIV-1流行毒株亚型的分子流行病学特征,采集桂林市HIV-1感染者的抗凝全血样品42份,分离PBMC并提取DNA,用巢氏PCR方法扩增病毒env基因,并进行序列测定和亚型分析。系统进化分析表明,桂林市HIV-1感染者样品分别属于4亚型:重组型CRF01-AE亚型4份、重组型CRF08-BC亚型15份、重组型CRF07-BC亚型8份和01C亚型3份。可见,桂林市HIV-1感染者中流行毒株主要为CRF-BC,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时制定新的防治策略。

关键词: HIV-1, 亚型, 巢氏PCR

Abstract: To investigate the subtype distribution and the prevalence of sequence characteristics of HIV-1 strains in Guilin residents and to analyze the relationship between distribution of HIV-1 subtypes and transmissionroutines,blood samples from 42 HIV-1 infected individuals from Guilin residents and separated PBMC specimens were collected.DNAs were extracted and the envgene was amplified by nest-PCR.PCR products were sequenced directly and phlogenetic analyses of gag gene was performed using the MEGA3 software.Among 42 HIV-1 blood samples,30 env gene fragments were amplified and analyzed.Two HIV-1 subtypeswere identified in Guilin residents and more attention should be paid to the surveillance of HIV-1 gene variation.

Key words: HIV-1, subtype, Nest-polymerase chain reaction

中图分类号: 

  • R512.91
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