尼罗罗非鱼选育家系的遗传多样性研究

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2014, Vol. 32 ›› Issue (3): 94-101.

尼罗罗非鱼选育家系的遗传多样性研究

张永德¹, 曾兰¹, 宾石玉², 杜雪松^1,2, 杨慧赞¹, 陈忠¹, 余艳玲¹, 林勇¹

1.广西水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁530021;
2.广西师范大学生命科学学院,广西桂林541004

收稿日期:2014-04-11 出版日期:2014-09-25 发布日期:2018-09-25
通讯作者: 林勇(1969—),男,广西玉林人,广西水产科学研究所研究员。E-mail:linnn2005@126.com
基金资助:
国家农业科技成果转化基金资助项目(2012GB2E100354);广西科学研究与技术开发计划基金资助项目(桂科合1298014-7、桂科转1222017-27);广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项基金资助项目(GXIF-2012-5、GXIF-2014-16、GXIF-2014-17);广西自然科学基金资助项目(2013GXNSFBA019121);国家农业现代产业体系广西罗非鱼创新团队专项基金资助;八桂学者建设工程专项基金资助

Genetic Diversity Analysis of Nile Tilapia Breeding Families

ZHANG Yong-de¹, ZENG Lan¹, BIN Shi-yu², DU Xue-song^1,2, YANG Hui-zan¹, CHEN Zhong¹, YU Yan-ling¹, LIN Yong¹

1. Guangxi Academy of Fishery Sciences, Guangxi Key Laboratory of Aquatic Genetic Breeding and Healthy Aquaculture, Nanning Guangxi 530021, China;
2. College of Life Sciences, Guangxi Normal University, Guilin Guangxi 541004, China

Received:2014-04-11 Online:2014-09-25 Published:2018-09-25

摘要/Abstract

摘要： 近年来,微卫星标记技术因其引物通用性强、检测快速、多态信息含量高等优点发展并成为各种物种基因组作图的首选标记。本文利用11个微卫星标记分析14个尼罗罗非鱼家系的遗传多样性,研究尼罗罗非鱼群体的遗传多样性和家系间的遗传关系。结果表明,11个微卫星位点扩增产物具有多态性,每个位点平均等位基因数为8.36;14个尼罗罗非鱼家系的平均多态信息含量、平均杂合度、平均有效等位基因数分别为0.499 3、0.558 3、2.608 0,表现为较高的遗传多态性。对14个尼罗罗非鱼家系间的遗传距离分析发现,家系NT207与NT213遗传距离最小,为0.204 4;家系NT208与NT210遗传距离最大,为0.760 9。14个尼罗罗非鱼家系间的平均遗传相似性指数为0.649 6,平均遗传距离为0.440 2。UPGMA系统树分析结果表明,家系NT215、NT218、NT210与NT211构成一个分支;家系NT214、NT203、NT206、NT207、NT213、NT217、NT209与NT216构成另一个分支;而家系NT208、NT201与其他家系的遗传距离则较远,分别构成独立的分支。

关键词: 罗非鱼, 微卫星标记, 遗传多样性, 亲缘关系

Abstract: The genetic diversity and genetic relationship of 14 Nile tilapia Oreochromis niloticus families were analyzed using 14 microsatellite markers. The genetic analysis of 14 tilapia families showed that:Polymorphic bands could be amplified in 11 pairs of primers and the average number of alleles in each pair of primers was 8.36. 14 tilapia families had a higher genetic polymorphism. The average polymorphism information contents, the average heterozygosities and the average effective allele numbers were 0.499 3, 0.558 3 and 2.608 0, respectively. Pedigree analysis among the 14 Nile tilapia families showed that Family NT207 and NT213 had the smallest genetic distance of 0.204 4, and Family NT208 and NT210 had maximum genetic distance 0.760 9. The average Nei’s genetic identity and average genetic distance among the 14 Nile tilapia families were 0.649 6 and 0.440 2, respectively. UPGMA phylogenetic tree analysis showed that NT215, NT218, NT210 and NT211 clustered to one branch, while NT214, NT203, NT206, NT207, NT213, NT217, NT209 and NT216 clustered to another branch, while NT208 and NT201 had far genetic distance with other families, each forming a separate branch.

Key words: tilapia, microsatellite marker, genetic diversity, genetic relationship

中图分类号:

Q959.483

张永德, 曾兰, 宾石玉, 杜雪松, 杨慧赞, 陈忠, 余艳玲, 林勇. 尼罗罗非鱼选育家系的遗传多样性研究[J]. 广西师范大学学报（自然科学版）, 2014, 32(3): 94-101.

ZHANG Yong-de, ZENG Lan, BIN Shi-yu, DU Xue-song, YANG Hui-zan, CHEN Zhong, YU Yan-ling, LIN Yong. Genetic Diversity Analysis of Nile Tilapia Breeding Families[J]. Journal of Guangxi Normal University(Natural Science Edition), 2014, 32(3): 94-101.

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